蛋白质的结构与功能
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一、蛋白质的结构与功能思维导图模板大纲
aa是pro的基本单位
aa通式
自然界300余种aa,人体组成20种,人体必需aa8种(均为L-α-aa)
8种必需氨基酸
缬异(亮)亮苯蛋色苏赖(写一两本淡色书来)
支链aa
缬异(亮)亮【借一两】】
一碳单位
丝色组甘
生糖兼生酮
异苯酪色苏(一本落色书)
生酮
亮、赖
氨基酸分类(根据侧链结构和理化性质)
非极性脂肪族aa
Gly甘/Ala丙/Val缬/Leu亮/Ile异亮/Pro脯/Met甲硫
极性中性
Ser/Cys半胱/Asn天冬酰胺/Gln谷氨酰胺/Thr苏
芳香族
Phe苯丙/Trp色氨酸/Tyr酪氨酸
酸性
Asp天冬氨酸/Glu谷
碱性
Arg精/His组氨酸/Lys赖
aa理化性质
①无色晶体,熔点极高(>200℃),不溶于有机溶剂
②两性解离,兼性离子
pH<pI:阳离子
pH>pI:阴
③紫外吸收:色>酪>苯丙aa的最大吸收峰都在280nm处,但峰值不同
应用:测定蛋白质含量
!区分:核酸的嘌呤嘧啶环的最大吸收峰在260nm处
④aa+茚三酮水合物→(加热)蓝紫色化合物的最大吸收峰在570nm处
应用:定量分析aa
aa常考特性
含两个氨基:赖 N-CCCC-R
含两个羧基:谷、天冬氨酸
含硫:甲硫、半胱
亚氨基酸/肽链容易折角:脯氨酸
在280nm波长有最大吸收峰:色氨酸
可结合正电荷:(酸性)谷、天冬氨酸
旋转自由度大、无对称、最小aa:甘氨酸
肽键和肽
肽键:本质是酰胺键
aa通过肽键相连成肽/pro
肽
分类(按aa数目)
aa<10:寡肽
10<aa<50:多肽
aa>50:蛋白质
肽链有方向性:从N端→C端
元素:C H O N S (有的含P I 金属元素)
其中N元素含量相对稳定,16%→ 1g N=6.25g pro
结构:
一级结构
定义
指蛋白质中从N端到C端的aa组成和排列顺序
维系键
肽键(主要)
二硫键(次要)
意义
一级结构是pro空间构象、特定生物学功能的基础(但不是决定构象的唯一因素)
二级结构
定义
指pro中某一段肽链的局部空间结构,即主链骨架原子的相对空间位置,不涉及aa残基侧链的构象
肽单元
组成肽键的6个原子:C1、C、O、N、H、C2 (C1 C2 为反式)
肽键长:0.132nm(介于单双之间,不能自由旋转)
表现形式
α-螺旋
指主链绕中心轴顺时针(右)螺旋上升
所有aa均可参与组成α-螺旋常见:Ala、Glu、Leu、Met
稳定性:靠氢键维系【氢键方向与长轴平行】
外侧:aa侧链
内侧:肽链
3.66AA上升一圈,螺距0.54nm
β-折叠
指主链折纸状,每个肽单元以Cα为旋转点,依次折叠成锯齿状
aa侧链交替位于锯齿状的上下方
一条肽链的若干肽段的锯齿状结构可平行排列:平行、反平行
β-转角
指肽链进行180°回转形成折角
β-转角常由4个aa残基组成,第2个残基常为脯;常见残基:甘、天冬氨酸、天冬酰胺、色
Ω环
指肽段形状像字母Ω
常存在球状pro中,在分子表面,在分子识别有作用
维系键
氢键
四种结构的比较
维系所有高级结构的键:氢键
三级结构
定义:
指整个肽链中所有aa残基的相对空间位置,就是肽链所有原子的空间排布位置!
维系键
疏水键
盐键
氢键
范德华力
表现形式
结构模体(超二级结构)
定义
2个及以上的有二级结构的肽段在空间上的结构(非极性aa参与
αα
βαβ
ββ
常见模体
α-螺旋--β-转角--α螺旋
见于DNA结合蛋白
链--β-转角--链
反平行β-折叠的pro
链--β-转角--α-螺旋--β-转角--链
表现形式
亮氨酸拉链
两个两用性的α螺旋疏水面相互作用,形成圈对圈的二聚体结构,亮氨酸每6个aa就出现一次
常在真核DNA结合蛋白的C端与癌基因表达调控有关!!
锌指结构
由1个α-螺旋、2个反平行β-折叠的三个肽段组成
功能:结合DNA或RNA
钙离子结合蛋白(螺旋-环-螺旋)
氢键结合钙离子
结构域
定义
结构紧密而稳定的区域,各有其功能
功能
球状蛋白质的独立折叠单位;酶水解之后,蛋白质分解成多个独立的结构域,构象、功能不变;!超二级结构则会构象改变
分子伴侣
定义
可识别肽链的非天然构象,促进各功能域和整体蛋白质正确折叠的保守蛋白质(pro才有功能)
新合成的pro需在分子伴侣的帮助下折叠成正确的空间构象,然后发挥其生物学功能
分类
热休克蛋白70
伴侣蛋白
肌红蛋白(储存氧气)
1条肽链,1个血红素(辅基),75%为α-螺旋
球状,表面是亲水R基,疏水的在分子内部形成疏水口袋,血红素位于其中
四级结构
定义
!!不是所有的蛋白质都有四级结构,有2条及以上的亚基的肽才有四级结构; 亚基:每一条有完整的三级结构的肽链~
指蛋白质分子中各个亚基的空间排布
维系键
氢键
离子键
血红蛋白HB
2个肽链(α、β亚基),可结合2个血红素辅基
运输、释放氧
四个亚基通过8个离子键链接
细胞组分、物质运输、催化、信息交流、免疫功能、氧化供能、维持酸碱平衡、维持血浆胶体渗透压
载脂蛋白运输脂质;清蛋白与脂肪酸、钙离子、胆红素、磺胺结合;保护机体的抗体是蛋白质
病例理况下,蛋白质氧化供能
蛋白质缓冲体系
血浆胶体渗透液压 主要有血浆清蛋白维持
相互作用
pro和核酸相互作用
pro是基因表达的产物,基因表达又离不开pro
pro和小分子相互作用
如酶的催化、转运、信息传递
pro和pro相互作用(执行功能的主要方式!!)
蛋白质翻译、细胞增殖等
蛋白质一级结构与功能
构象的基础,但还要分子伴侣、折叠酶的帮助
功能的基础
一级结构相似,构象和功能也相似
种属差异和分子进化
从aa序列了解生物进化信息;进行一级结构测定和比较,发现有种属差异
aa序列改变可导致分子病
血红蛋白β亚基的第6位aa从谷氨酸→缬氨酸,导致镰刀型贫血症
原因:碱基错配/碱基突变/DNA点突变
区分:疯牛病是构象病
蛋白质高级结构与功能
只有具有高级结构的蛋白质,才能表现出生物学功能(蛋白质只要一级结构未被破坏,构象变了但仍可复性)
新合成的酶以酶原的形式存在,只有经过特异的蛋白水解酶切去一段肽、暴露出活性中心,才能表现出活性!!
HB的空间构象变化和功能
结构
4条肽链(2个α肽链、2个β链),可结合4分子氧
功能
HB与氧可逆结合,氧解离曲线呈S形(构象变化影响亚基和氧的结合)
定义
空间构象改变使蛋白质功能改变,严重时引发疾病
疯牛病
朊病毒蛋白(Prp)引起的人和动物神经退行性病变。 正常的α螺旋的Prpc→异常β折叠的PrpSc,但PtpSc对蛋白酶不敏感、水溶性和热稳定性差,聚集形成淀粉样纤维沉淀、落在神经上致病
两性解离性
大多数蛋白质的等电点pI=5.0,在血浆中多解离为阴离子
紫外吸收
色、酪、苯丙氨酸最大吸收峰280nm
应用:测定蛋白质含量
呈色反应:
茚三酮反应
pro水解成aa;aa+茚三酮→蓝紫色化合物(570nm最大吸收峰)
可测定蛋白质含量!!
双缩脲反应
肽键在稀碱溶液中与硫酸铜加热,可呈紫色/红色
可检测蛋白质水解程度!!
胶体性质
蛋白质是大分子物质,有胶体性质
机制
pro表面有水化膜、带负电荷
水化膜阻止蛋白质颗粒相互集聚,防止沉淀析出
pH>pI,故蛋白质带负电,负负相斥,悬浮不沉淀
盐析
除去表面电荷、水化膜
加入中性盐破坏水化膜,调节pH=pI,不带电荷了,pro就沉淀了
变性
原因
pro特有的空间结构破坏、理化性质改变、生物活性丧失
因素
加热、强酸强碱、乙醇、重金属、生物碱
结果
s↓、结晶↓、粘度↑、活性↓、易被酶水解
特征
一级结构没变,共价键没破坏!!
但是破坏了二硫键、非共价键(氢键)
3220105695 宋可意 思维导图模板大纲