微生物多样性,精华,分类与鉴定等内容讲解
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微生物系统进化与分类知识点导图思维导图模板大纲
原始生命形式及其进化
生命起源的环境与物质要件
早期还原性大气
早期大气无游离氧
原始海洋
其理想生长场所
科学家表明,在热泉生态系统
生物进化尺度分子
微生物类群的划分指标特征
核酸、蛋白质用于系统发生关系的研究
比较生物分子序列,构造系统发生树
比较生物分子的序列,构造系统发生树
最适描述生物进化尺度的16SrRNA原因
适合不同距离生物亲缘关系的研究
其分子量大小适中,便于分析
普遍存在原核生物与真核生物,可作为测量各种生扬进化的尺度
PCR技术及分析对PCR扩增产物的序列用来判断生物之间的系统发育关系
1969 年康奈尔大学的 Rober t.H. Whittaker 依据细胞结构及获得营养的方式,在《Sei- ence》杂志上提出了五界学说,纵向显示原核生物界是真核生物界的前阶段,横向显示吸收式营养、光合营养(photosythesis)和摄取式营养这三大进化方向。
动物界(Animalia)
植物界(Plantae)
真菌界(fungi)
原生生物界(Protista)
原核生物界(Monera)
系统发育树
概念:研究生物进化和系统分类中,一种类似树状分支的图形概括各种生物之间的亲缘关系
组成
分子系统树:比较生物大分子序列差异的数值构建
结:分支的末端和其连接点,代表生物类群
1981年Woese等根据某些代表生物16S rRNA(或18S rRNA)序列比较,首次提出了一个涵盖整个生命界的系统树,而后又进行了多次修改和补充 。 由它分三条进化路线,形成了三个原界,如下
古细菌原界
产甲烷细菌、极端嗜盐菌、嗜热嗜酸菌
独特的性状
特殊的细胞膜脂类
细胞壁成分独特而多样
核糖体16SrRNA核苷酸序列独特
tRNA核苷酸序列独特
与真核生物起始密码相同
对抗生素敏感性较独特
生态环境较独特
有的严格厌氧如产甲烷菌
有的极端嗜盐菌
有的嗜热嗜酸菌
真细菌原界
蓝细菌
各种古细菌以外的其他原核生物
真核生物原界
原生生物
真菌
动物和植物
古细菌,真细菌,真核生物的比较
tRNA上TC环有无T
古细菌:无
真细菌:一般有
真核:一般有
二氢尿嘧啶
古细菌:除一种外,无
真细菌:一般有
真核:一般有
蛋白质合成起始氨基酸
古细菌:甲硫氨酸
真细菌:甲酰甲硫氨酸
真核:甲硫氨酸
核酸体亚基
古细菌:30S,50S
真细菌:30S,50S
真核:40S,60S
延伸因子
古细菌:可与白喉毒素反应
真细菌:不与白喉毒素反应
真核生物:与白喉毒素反应
对氯霉素敏感性
古细菌:不敏感
真细菌:敏感
真核生物:不敏感
对茴霉素敏感性
古细菌:敏感
真细菌:不敏感
真核生物:敏感
16S或18SrRNA上3`端有无AUCACCUCC结合片断
古细菌:有
真细菌:有
真核生物:无
RNA聚合酶的亚基数
古细菌:9~12
真细菌:4
真核生物:12~15
细胞膜中的脂类
古细菌:醚键,有分支直链
真细菌:酯键,无分支直链
真核:酯键,无分支直链
细胞壁
古细菌:多样,无胞壁酸
真细菌:多样,含胞壁酸
真核:动物无细胞壁,其他多样
微生物分类单元与等级:分类上的一般原则是,将相近似的种归纳在一起称为属,又把相近似的属归在一起称为科,依次类推,由科合为目,由目合为纲,由纲合为门等,由此构成一个完整的分类系统。
界,门,纲
目,科,属
种:最基本的分类单位,微生物分类中所描述的“种”,在不同程度上都有人为的、暂时的性质,而且也不可避免会出现一些混乱。
亚种或变种:从自然界分离到某一微生物的纯种,必须与已知的典型种(称为模式种 所记载的特征完全符合,才能鉴定为同一个种。
型
分类指标:生物型,血清型,噬菌体型
群或类群:有些微生物种类在特性上介于另外两种微生物之间且不易区分
菌株或品系:尽管同属一个种,但由于来源不同,它们之间总会出现一些细微的差异,我们就把这同种不同来源的纯培养称为不同的菌株。
细菌的分类系统简介
三个比较全面的细菌分类系统
苏联的克拉西里尼克夫著的《细菌和放线菌的鉴定》
美国布瑞德的《伯杰鉴定细菌学手册》✔(使用较广,较有代表性)例如
古细菌界(域):古细菌和最早的分支及光合细菌
泉古细菌门
广古细菌门
细菌界(域)
产液细菌门
热袍菌门
热脱硫杆菌门
屈挠菌门
热微菌门等
朊细菌,朊细菌门
a-朊细菌纲
β-朊细菌纲
γ-朊细菌纲
Σ-朊细菌纲
厚壁菌,厚壁菌门
梭菌纲
柔膜菌纲
芽孢杆菌纲
拟杆菌、螺旋体、无壁菌、酸细菌、丝杆菌等
浮霉菌门(Phylum:Planctomycetes)衣原体门(Phylum:Chlamydiae) 酸细菌门(Phylum:Acidobacteria)拟杆菌门(PhylumBacteroidetes ) 梭杆菌门(Phylum:Fusobacteria) 疣微菌门(Phylum:Verrucomicrobia ) 网团菌门(PhylumDictyoglomus)
螺旋体门
丝杆菌门
放线菌、放线细菌门
放线细菌纲:放线菌属于原核微生物,在《伯杰系统细菌学手册》第2版中放在细菌界(域) 由于放线菌发现较晚,早期还把它放在真菌中,直到20世纪60年代才认识到放线菌属于原核微生物。
放线菌的的分类系统中,较有代表性的,而且用得较广的有2个系统,即美国 Waksman 的分类系统和苏联的Krassilnikov的分类系统,
法国的普雷沃著的《细菌分类学》
真菌分类系统在这些分类系统中,仍然是以生态环境、形态特征、细胞结构、生殖行为作为主要的分类依据,结合系统发育的规律来划分。
Ainsworth系统(更为真菌分类学者所接受)
V.Arx系统
Kendrick系统
《真菌字典》
Alexopoulos&Mins系统
病毒分类系统比细菌、放线菌分类更为复杂,由病毒本身性质定
最早的病毒分离自可见(或显微镜下可见的)微生物和其他生物体中,如杰林克(Beijerinck)和伊凡诺夫斯基(Ivanovski)研究的TMV Loeffler 和 Frosch 研究的口蹄疫病毒(foot - and - mouth disease virus)以及 Reed 和Cami研究的黄热病病毒仅仅是对其物理化学特性或对其致病性进行鉴定
国际病毒分类委员会ICTV将其分成七类
双链DNA病毒
单链DNA病毒
DNA和RNA逆转录病毒
双链RNA病毒
负单链RNA病毒
正单链RNA病毒
亚病毒因子
按宿主不同分为
古细菌病毒、藻类病毒、细菌病毒、真菌病毒
非脊椎动物病毒、支原体病毒、植物病毒
脊椎动物病毒:哺乳动物和人类病毒由于和人类健康畜牧业直接相关,得到深入研究
微生物分类鉴定技术
1.形态学和生理生化特性
形态学:个体形态特征主要观察细胞外形、大小和排列方式等, 在细菌细胞构造方面,可观察有无运动性,鞭毛着生的部位及数目,在染色反应上,应进行革兰染色和抗酸性染色,说明是阳性还是阴性反应。在菌落形态上,是观察微生物在琼脂平板上培养后生成菌落的特征。
生理生化:生理生化的不同本质上是酶和蛋白质的不同,间接反映了微生物基因组的不同,如营养类型分析是判断微生物是属于光能自养、光能异养型等。 不同的微生物因生理特性的不同,而产生不同的代谢产物,通过检查代谢产物可以鉴定菌种。不同微生物所需要的温度范围不同,鉴定微生物就要查明它们生长的最适、最低和最高温度
2.血清学试验和噬菌体分型
血清学反应就是用已知菌种制成抗血清,用它鉴定对象发生特异性血清反应鉴定未知菌种或菌株的微小差异
噬菌体对宿主感染和裂解常常有高度特异性
3.细胞壁成分分析:如在放线菌分类中,已广泛应用细胞壁成分的分析作为分类的依据。如白乐杰诺卡菌 经细胞壁成分分析 白乐杰诺卡菌中 含有作为链霉菌属特征的丙氨酸、谷氨酸、甘氨酸和L-2,6-二氨基庚二酸,从而证实了白乐杰诺卡菌中的三株菌确属于链霉菌属。
子主题 1
子主题 2
4.气相色谱鉴定:每种物质的化学结构都有特定的红外吸收光谱,若两个样品的吸收光谱完全相同,可以初步认为它们是同一种物质, 这种技术先后对芽胞杆菌、乳酸杆菌、大肠杆菌和酵母菌 放线菌等进行分类,其优点是简单快速,用少量的样品。
5.核酸分析和分子杂交:DNA特征作为分类依据有GC含量测定、核酸杂交技术和序列分析等
GC百分比值用于微生物鉴定时要与其他分类方法结合使用
G+C百分比值相同的微生物可能属于完全不同的两个种。 如果两条DNA的碱基对排列序列完全互补,那么它们就可以生成完整的杂交双链,即杂交率为100%;如果双链只有部分互补,那么它们的杂交率就低于100%,也就是在杂交双链中含有部分不配对的单链。杂交率越高,表明它们之间的亲缘关系越接近。
核酸序列分析主要比较23S、16S 和5S rRNA的序列同源性,尤其是16S rRNA 的序列特别重要,因为这是原核生物中比较保守的寡聚核甘酸,其同源性大小可决定亲缘关系的远近。
6.数值分类法:又称统计分类法,是借助计算机技术发展起来的,它与别的传统分类法如下
①传统法采用的分类特征有主次之分。而数值法根据“等重要原则”,不分主次,通过计算菌株间的总相似值来分群归类。
②传统法根据少数几个特征,采用双歧法整理实验结果,排列出一个个分类群。而数值法采用的特征较多,一是50~60个,多的则达到100个特征以上,进行菌株间两两比较,数据处理量较大,需借助于计算机才能实现。
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树图思维导图提供 第六章 群体传播与组织传播_副本 在线思维导图免费制作,点击“编辑”按钮,可对 第六章 群体传播与组织传播_副本 进行在线思维导图编辑,本思维导图属于思维导图模板主题,文件编号是:1672f555831e7d9a3bb2cf2fb792cb49