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微生物系统进化与分类知识点导图思维导图

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微生物多样性,精华,分类与鉴定等内容讲解

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思维导图大纲

微生物系统进化与分类知识点导图思维导图模板大纲

微生物进化及其多样性

原始生命形式及其进化

生命起源的环境与物质要件

早期还原性大气

早期大气无游离氧

原始海洋

其理想生长场所

科学家表明,在热泉生态系统

生物进化尺度分子

微生物类群的划分指标特征

核酸、蛋白质用于系统发生关系的研究

比较生物分子序列,构造系统发生树

比较生物分子的序列,构造系统发生树

最适描述生物进化尺度的16SrRNA原因

适合不同距离生物亲缘关系的研究

其分子量大小适中,便于分析

普遍存在原核生物与真核生物,可作为测量各种生扬进化的尺度

PCR技术及分析对PCR扩增产物的序列用来判断生物之间的系统发育关系

1969 年康奈尔大学的 Rober t.H. Whittaker 依据细胞结构及获得营养的方式,在《Sei- ence》杂志上提出了五界学说,纵向显示原核生物界是真核生物界的前阶段,横向显示吸收式营养、光合营养(photosythesis)和摄取式营养这三大进化方向。

动物界(Animalia)

植物界(Plantae)

真菌界(fungi)

原生生物界(Protista)

原核生物界(Monera)

系统发育树

概念:研究生物进化和系统分类中,一种类似树状分支的图形概括各种生物之间的亲缘关系

组成

分子系统树:比较生物大分子序列差异的数值构建

结:分支的末端和其连接点,代表生物类群

1981年Woese等根据某些代表生物16S rRNA(或18S rRNA)序列比较,首次提出了一个涵盖整个生命界的系统树,而后又进行了多次修改和补充 。 由它分三条进化路线,形成了三个原界,如下

古细菌原界

产甲烷细菌、极端嗜盐菌、嗜热嗜酸菌

独特的性状

特殊的细胞膜脂类

细胞壁成分独特而多样

核糖体16SrRNA核苷酸序列独特

tRNA核苷酸序列独特

与真核生物起始密码相同

对抗生素敏感性较独特

生态环境较独特

有的严格厌氧如产甲烷菌

有的极端嗜盐菌

有的嗜热嗜酸菌

真细菌原界

蓝细菌

各种古细菌以外的其他原核生物

真核生物原界

原生生物

真菌

动物和植物

古细菌,真细菌,真核生物的比较

tRNA上TC环有无T

古细菌:无

真细菌:一般有

真核:一般有

二氢尿嘧啶

古细菌:除一种外,无

真细菌:一般有

真核:一般有

蛋白质合成起始氨基酸

古细菌:甲硫氨酸

真细菌:甲酰甲硫氨酸

真核:甲硫氨酸

核酸体亚基

古细菌:30S,50S

真细菌:30S,50S

真核:40S,60S

延伸因子

古细菌:可与白喉毒素反应

真细菌:不与白喉毒素反应

真核生物:与白喉毒素反应

对氯霉素敏感性

古细菌:不敏感

真细菌:敏感

真核生物:不敏感

对茴霉素敏感性

古细菌:敏感

真细菌:不敏感

真核生物:敏感

16S或18SrRNA上3`端有无AUCACCUCC结合片断

古细菌:有

真细菌:有

真核生物:无

RNA聚合酶的亚基数

古细菌:9~12

真细菌:4

真核生物:12~15

细胞膜中的脂类

古细菌:醚键,有分支直链

真细菌:酯键,无分支直链

真核:酯键,无分支直链

细胞壁

古细菌:多样,无胞壁酸

真细菌:多样,含胞壁酸

真核:动物无细胞壁,其他多样

微生物分类与鉴定

微生物分类单元与等级:分类上的一般原则是,将相近似的种归纳在一起称为属,又把相近似的属归在一起称为科,依次类推,由科合为目,由目合为纲,由纲合为门等,由此构成一个完整的分类系统。

界,门,纲

目,科,属

种:最基本的分类单位,微生物分类中所描述的“种”,在不同程度上都有人为的、暂时的性质,而且也不可避免会出现一些混乱。

亚种或变种:从自然界分离到某一微生物的纯种,必须与已知的典型种(称为模式种 所记载的特征完全符合,才能鉴定为同一个种。

分类指标:生物型,血清型,噬菌体型

群或类群:有些微生物种类在特性上介于另外两种微生物之间且不易区分

菌株或品系:尽管同属一个种,但由于来源不同,它们之间总会出现一些细微的差异,我们就把这同种不同来源的纯培养称为不同的菌株。

细菌的分类系统简介

三个比较全面的细菌分类系统

苏联的克拉西里尼克夫著的《细菌和放线菌的鉴定》

美国布瑞德的《伯杰鉴定细菌学手册》✔(使用较广,较有代表性)例如

古细菌界(域):古细菌和最早的分支及光合细菌

泉古细菌门

广古细菌门

细菌界(域)

产液细菌门

热袍菌门

热脱硫杆菌门

屈挠菌门

热微菌门等

朊细菌,朊细菌门

a-朊细菌纲

β-朊细菌纲

γ-朊细菌纲

Σ-朊细菌纲

厚壁菌,厚壁菌门

梭菌纲

柔膜菌纲

芽孢杆菌纲

拟杆菌、螺旋体、无壁菌、酸细菌、丝杆菌等

浮霉菌门(Phylum:Planctomycetes)衣原体门(Phylum:Chlamydiae) 酸细菌门(Phylum:Acidobacteria)拟杆菌门(PhylumBacteroidetes ) 梭杆菌门(Phylum:Fusobacteria) 疣微菌门(Phylum:Verrucomicrobia ) 网团菌门(PhylumDictyoglomus)

螺旋体门

丝杆菌门

放线菌、放线细菌门

放线细菌纲:放线菌属于原核微生物,在《伯杰系统细菌学手册》第2版中放在细菌界(域) 由于放线菌发现较晚,早期还把它放在真菌中,直到20世纪60年代才认识到放线菌属于原核微生物。

放线菌的的分类系统中,较有代表性的,而且用得较广的有2个系统,即美国 Waksman 的分类系统和苏联的Krassilnikov的分类系统,

法国的普雷沃著的《细菌分类学》

真菌分类系统在这些分类系统中,仍然是以生态环境、形态特征、细胞结构、生殖行为作为主要的分类依据,结合系统发育的规律来划分。

Ainsworth系统(更为真菌分类学者所接受)

V.Arx系统

Kendrick系统

《真菌字典》

Alexopoulos&Mins系统

病毒分类系统比细菌、放线菌分类更为复杂,由病毒本身性质定

最早的病毒分离自可见(或显微镜下可见的)微生物和其他生物体中,如杰林克(Beijerinck)和伊凡诺夫斯基(Ivanovski)研究的TMV Loeffler 和 Frosch 研究的口蹄疫病毒(foot - and - mouth disease virus)以及 Reed 和Cami研究的黄热病病毒仅仅是对其物理化学特性或对其致病性进行鉴定

国际病毒分类委员会ICTV将其分成七类

双链DNA病毒

单链DNA病毒

DNA和RNA逆转录病毒

双链RNA病毒

负单链RNA病毒

正单链RNA病毒

亚病毒因子

按宿主不同分为

古细菌病毒、藻类病毒、细菌病毒、真菌病毒

非脊椎动物病毒、支原体病毒、植物病毒

脊椎动物病毒:哺乳动物和人类病毒由于和人类健康畜牧业直接相关,得到深入研究

微生物分类鉴定技术

1.形态学和生理生化特性

形态学:个体形态特征主要观察细胞外形、大小和排列方式等, 在细菌细胞构造方面,可观察有无运动性,鞭毛着生的部位及数目,在染色反应上,应进行革兰染色和抗酸性染色,说明是阳性还是阴性反应。在菌落形态上,是观察微生物在琼脂平板上培养后生成菌落的特征。

生理生化:生理生化的不同本质上是酶和蛋白质的不同,间接反映了微生物基因组的不同,如营养类型分析是判断微生物是属于光能自养、光能异养型等。 不同的微生物因生理特性的不同,而产生不同的代谢产物,通过检查代谢产物可以鉴定菌种。不同微生物所需要的温度范围不同,鉴定微生物就要查明它们生长的最适、最低和最高温度

2.血清学试验和噬菌体分型

血清学反应就是用已知菌种制成抗血清,用它鉴定对象发生特异性血清反应鉴定未知菌种或菌株的微小差异

噬菌体对宿主感染和裂解常常有高度特异性

3.细胞壁成分分析:如在放线菌分类中,已广泛应用细胞壁成分的分析作为分类的依据。如白乐杰诺卡菌 经细胞壁成分分析 白乐杰诺卡菌中 含有作为链霉菌属特征的丙氨酸、谷氨酸、甘氨酸和L-2,6-二氨基庚二酸,从而证实了白乐杰诺卡菌中的三株菌确属于链霉菌属。

子主题 1

子主题 2

4.气相色谱鉴定:每种物质的化学结构都有特定的红外吸收光谱,若两个样品的吸收光谱完全相同,可以初步认为它们是同一种物质, 这种技术先后对芽胞杆菌、乳酸杆菌、大肠杆菌和酵母菌 放线菌等进行分类,其优点是简单快速,用少量的样品。

5.核酸分析和分子杂交:DNA特征作为分类依据有GC含量测定、核酸杂交技术和序列分析等

GC百分比值用于微生物鉴定时要与其他分类方法结合使用

G+C百分比值相同的微生物可能属于完全不同的两个种。 如果两条DNA的碱基对排列序列完全互补,那么它们就可以生成完整的杂交双链,即杂交率为100%;如果双链只有部分互补,那么它们的杂交率就低于100%,也就是在杂交双链中含有部分不配对的单链。杂交率越高,表明它们之间的亲缘关系越接近。

核酸序列分析主要比较23S、16S 和5S rRNA的序列同源性,尤其是16S rRNA 的序列特别重要,因为这是原核生物中比较保守的寡聚核甘酸,其同源性大小可决定亲缘关系的远近。

6.数值分类法:又称统计分类法,是借助计算机技术发展起来的,它与别的传统分类法如下

①传统法采用的分类特征有主次之分。而数值法根据“等重要原则”,不分主次,通过计算菌株间的总相似值来分群归类。

②传统法根据少数几个特征,采用双歧法整理实验结果,排列出一个个分类群。而数值法采用的特征较多,一是50~60个,多的则达到100个特征以上,进行菌株间两两比较,数据处理量较大,需借助于计算机才能实现。

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